В 1192 году на правом берегу полноводной реки Полисти был выстроен одноэтажный деревянный храм Преображения Господня. В этот же год к храму были пристроены тесные кельи. Все это сооружение стало называться Спасо – Преображенским монастырем. Основателем монастыря и первым игуменом здесь стал Мартирий, который, впоследствии,  принял сан архиепископа Новгородского. Летописи гласят, что Мартирий был родом из этих мест, поэтому ему очень хотелось оставить на родной земле память о себе.

Несладко пришлось монастырю и его обитателям во время шведских и литовских набегов. Не раз и не два он был разорен, но снова восстанавливался,  благодаря стараниям послушников. Двести лет простоял храм и монастырь, основанный Мартирием. За эти годы постройки пришли в полную негодность из-за ветхости всех конструкций.

Архиепископ Новгородский Евфимий выдает повеление о строительстве нового храма и монастыря. С помощью жителей Старой Руссы в 1442 году такая каменная церковь была выстроена. И хотя строительство велось на старом фундаменте, новые постройки оказались гораздо выше прежних.

Окончательно Спасо-Преображенский монастырь был реконструирован к 1628 году. На нижних этажах были устроены монастырские кельи, все деревянные конструкции и перекрытия были заменены на каменные.

Обновленный Спасо-Преображенский монастырь включал в себя величественный Спасский собор, небольшой храм Сретения Господня и храм Рождества Христова. Все эти здания были соединены между собой пристройками. В 1630 году к северной стене Спасского храма была пристроена небольшая колокольня. Внутри самого храма в те годы находились бесценные реликвии: части мощей пятидесяти святых угодников, а также знаменитая Старорусская икона Божьей Матери.

Эта святыня имела достаточно большие размеры и была щедро украшена позолотой и драгоценными камнями. Как гласит предание, икону эту доставили в Старую Руссу греки из Ольвиополя еще в X веке. В 1570 году икона была передана жителям Тихвина по случаю,  возникшей там эпидемии морового поветрия. С помощью этой святыни мор удалось остановить, но икона вернулась в Старую Руссу лишь в 1888 году после конфликта, который удалось урегулировать лишь с помощью священного синода. В честь возвращения иконы был проведен ремонт во всех сооружениях и церквях монастыря. К сожалению, бесценное сокровище - Старорусская икона Божьей Матери,  была украдена фашистами во время Отечественной войны. Ее следы были навсегда потеряны, и сегодня,  уже нет никакой надежды, найти святыню.

К 19 веку комплекс монастырских строений полностью сформировался. Здесь было открыто духовное училище, а также приходская школа.

Тот Спасо-Преображенский монастырь, который можно видеть в Старой Руссе сегодня – это комплекс, который был выстроен в 18 веке. Монастырю чудом удалось избежать разрушения в годы Великой Отечественной войны . Позднее он был немного отреставрирован и отдан во владение городу.

Сейчас в помещениях монастыря находятся экспозиции городского краеведческого музея, а в здании собора выставлены уникальные фрески XV-XVII веков